Nasce in Tunisia, nella regione di Tozeur, nel 1963. Dopo gli studi universitari, intraprende la professione medica. Nel 2011 pubblica il suo primo romanzo, Le Baiser de Lampedusa, ispirato alle traversie delle migliaia di migranti tunisini che sfidano il deserto e le onde del Mediterraneo per raggiungere le coste italiane e francesi. Mounir Charfi vive attualmente a Tunisi.